Les commissions sont des groupes de réflexion et de travail s'interrogeant sur les aspects sociaux et culturels que peuvent revêtir les sciences physiques aujourd'hui. La SFP compte actuellement 6 commissions.
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Energie et Environnement
Enseignement
Femmes et Physique
Histoire des sciences
Physique / Optique sans frontières
Publications scientifiques et Science ouverte